1997年10月18日至20日，中共张家界市武陵源区第一次代表大会胜利召开；同年7月，武陵源被评为“全国森林公园十大标兵单位”。

1998年1月，武陵源黄龙洞景区实行委托经营45年；同年4月，坦桑尼亚总统姆卡帕考察武陵源；同年10月，香港特别行政区首任行政长官董建华考察武陵源。

1999年9月22日，中国生态环境游湖南张家界国际森林保护节开幕式及文艺演出在武陵源举行；同年11月，黄龙洞公司策划、组织和实施“穿越天门”张家界世界特技飞行大奖赛。

2000年3月，武陵源区公安局被授予“全国优秀公安局”；同年10月，武陵源高云大桥、格格洞大桥通车。

2001年1月1日，《湖南省武陵源世界自然遗产保护条例》正式实施；同年10月起，武陵源核心景区水绕四门、天子山宾馆酒店开始拆除。

2002年10月20日至21日，中共张家界市武陵源区第二次代表大会胜利召开；同年9月18日，2002中国湖南旅游节闭幕式在武陵源水绕四门举行。

2003年1月，武陵源核心景区开通环保车；同年8月，世界最高户外观光电梯百龙天梯正式运行；同年10月，全国第五届城市运动会皮划艇激流回旋比赛在武陵源举行。

2004年7月3日，联合国专家在武陵源风景名胜区水绕四门为“张家界世界地质公园”正式揭牌。同年8月，武陵源通过ISO和OHSAS三大国际标准化管理体系认证。

2005年4月16日，武陵源核心景区门票价格执行新的标准，全价票由原来的158元/人调整为245元/人；同年12月，武陵源先后被评为全国创建文明风景旅游区工作先进单位、全国社会治安综合治理先进集体。